Les équipes qualifiées pour les huitièmes de finale sont : les Girondins de Bordeaux (France) et le Bayern Munich (Allemagne). La Juventus de Turin (Italie) jouera la Ligue Europa.
| 1 | bordeaux | 16 |
| 2 | bayern munich | 10 |
| 3 | juventus turin | 8 |
| 4 | maccabi haïfa |
| date | rencontre | heure | |||
| mar 15/09/2009 | juventus | 1 | 1 | bordeaux | 20h45 |
| | maccabi | 3 | munich | 20h45 | |
| mer 30/09/2009 | munich | juventus | 20h45 | ||
| | bordeaux | 1 | maccabi | 20h45 | |
| mer 21/10/2009 | bordeaux | 2 | 1 | munich | 20h45 |
| | juventus | 1 | maccabi | 20h45 | |
| mar 03/11/2009 | munich | 2 | bordeaux | 20h45 | |
| | maccabi | 1 | juventus | 20h45 | |
| mer 25/11/2009 | bordeaux | 2 | | juventus | 20h45 |
| | munich | 1 | maccabi | 20h45 | |
| mar 08/12/2009 | maccabi | 1 | bordeaux | 20h45 | |
| | juventus | 1 | 4 | munich | 20h45 |